По его мнению, ЕГЭ может вызвать у школьников «рвотную реакцию на слово биология». Учёный ответил правильно на 17 вопросов экзамена, но ошибся ещё с 4. В итоге выпускные экзамены он не сдал. Кукушкин раскритиковал концепцию ЕГЭ заявив, что большая часть знаний, проверяемых в нём, никогда не пригодится ученику 11 класса, а большая часть вопросов попали туда просто потому, что их легко подстроить под тест.

В интервью каналу «360» он отметил, что как преподаватель он сам регулярно сталкивается со схожей проблемой — после курса лекций ему необходимо проверить знания студентов, но из-за огромного объёма учебного материала ему приходится выбирать, что именно попадёт в контрольные задания.

При этом он также подчеркнул, что проблема «чугунного» ЕГЭ относится не только к России, но и к странам Запада, где тоже распространено централизованное тестирование. Исследователь сказал, что ему не нравится такой подход, но он не может предложить готового решения проблемы в масштабах целой страны, поскольку сам он преподаёт в небольших группах и может проявлять индивидуальный подход к своим ученикам.

Во «Вконтакте» он привёл пример такого подхода — преподаватель признался, что может зачесть студенту неправильный вариант ответа, если тот сможет научно доказать и обосновать своё суждение.

Напомним, что из-за эпидемии коронавируса ЕГЭ в этом году было перенесено на вторую половину июня, а ОГЭ и вовсе было отменено.