Капчук уехал из страны в начале 2000-х годов, когда в отношении него было возбуждено уголовное дело о мошенничестве со средствами Свердловской железной дороги. Некоторое время он жил в ОАЭ, затем — в Великобритании. Свое уголовное дело он считает заказным.

В России его объявили в международный розыск. В ноябре 2016 года Сергей Капчук распространил документ, согласно которому он больше не находится в розыске Интерпола, а в его действиях состав уголовного преступления отсутствует.

В июне 2018 года Капчук вернулся в Россию. Это произошло после того, как бизнес-омбудсмен Борис Титов обратился к президенту России Владимиру Путину с предложением рассмотреть условия для прекращения международного розыска и изменения заочно избранных мер пресечения в виде заключения под стражу в отношении нескольких десятков предпринимателей, желающих вернуться в страну из-за границы. При этом Сергей Капчук стал первым из «списка Титова», кто решился приехать в страну.

Его брат-близнец Константин Капчук, который был обвиняемым по тому же самому делу, уже отбыл свой срок, вышел на свободу и живет в Екатеринбурге.