По версии специалистов, проводивших экспертизу, СВУ спрятали под полиэтиленовой пленкой, плотный слой которой стал оболочкой устройства. Спрятанный под пленкой детонатор сработал от сигнала GPS-навигатора «в момент прохождения заранее заданной точки маршрута».

Основным зарядом стала смесь взрывчатого вещества на основе твердого ракетного топлива и мелкодисперсных металлов. Для «возбуждения детонации» применили зарубежное взрывчатое вещество на основе гексогена — скорее всего, C-4 или PE-8.

Следователи Управление по расследованию преступлений против личности и общественной безопасности ГСУ СК России пришли к выводу, что взрыв организовал председатель СБУ Василий Малюк. Он заочно арестован в России и объявлен в международный розыск.

Кроме него в теракте очно обвиняются граждане России, Армении и Украины: Александр Былин, Артем и Георгий Азатьяны, Олег Антипов, Владимир Злоб, Артур Терчанян, Роман Соломко и Дмитрий Тяжелых — их подозревают в том, что они доставили взрывчатку до места взрыва под видом груза.